Главный приоритет экологической политики ПАТЭС – обеспечение экологической безопасности и снижение воздействия на экологию в регионе.
Для Чукотского АО, с разрозненными населенными пунктами и объектами промышленности, характерно наличие большого числа отдельно стоящих дизельных станций, а в самом центре города Певек находится устаревшая Чаунская ТЭЦ. C развитием сетевой инфраструктуры ПАТЭС сможет заместить мощности Билибинской АЭС, городской ТЭЦ, а также объектов «малой энергетики», избавив тем самым регион от излишнего загрязнения.
При этом все системы обращения с ядерным топливом и радиоактивными материалами ПАТЭС расположены исключительно внутри ПЭБ, включая перегрузку активной зоны и хранение отработавшего топлива. Работа с ионизирующим излучением ведется также только на борту. Сброс радиоактивных отходов в забортное пространство полностью отсутствует.
Система нагрева воды для получения тепла производится через промежуточный контур и исключает ее возможное загрязнение радиоактивными веществами.
Таким образом, на ПАТЭС радиационное воздействие на население и окружающую среду при нормальной эксплуатации и любых аварийных ситуациях не превышает уровень естественного радиационного фона.
В санитарно-защитной зоне вокруг плавучей атомной теплоэлектростанции ведется постоянный мониторинг радиационной обстановки.
